Бастауын [[Жетісу Алатауы]]ндағы Басқан мұздығының оңтүстігінен алып, [[Көксу (Көксу ауданы)|Көксу]] темір жол станциясында тұсында [[Қаратал (өзен, Балқаш алабы)|Қаратал]] өзеніне құяды.
Көксу өзені Жоңғар Алатауының батыс бөлігінде орналасқан (қазақша «аспан суы» деп аударылған). Бұл өзеннің сол жақ саласы-Қаратал. Бұл 3500 м биіктіктегі мұздықтардың түбінен басталады, бұл ұзындығы 210 км тау жүйесіндегі үшінші өзен. Су жинау алаңы бойынша (4670 шаршы км). Ауыз судың орташа жылдық шығыны шамамен 57 м³ / с құрайды.
Көксу 162 мұздықты қамтиды, олардың жалпы ауданы 205 шаршы метр. км құрайды Ауыл үшін Көксу өзені өзеннің сол жақ саласына ене бастайды. Су ағынын екі есеге арттыруға ықпал етеді.Көктал өзенінің бас жағында аумағы 98,4 шаршы метрге дейінгі 72 мұздық бар көлемі 98,4 ш км құрайды
Көксу аралас өзен: қар-мұз және жер асты сулары. Наурыздың ортасынан бастап өзенде су тасқыны басталып, қар ериді. Мамыр айының екінші жартысынан бастап тауларда қардың күрт еруіне байланысты екінші толқын пайда болады. Алайда солтүстік беткейлерде қарлы жерлер тамызға дейін сақталады.
